R and RStudio

Para este curso necesitamos que instales R y Rstudio

Install R

  1. Ir al sitio de CRAN
  2. Selecciona tu sistema operativo (Windows or Mac)
  3. Sigue las instrucciones

Instala RStudio

  1. Ir al sitio de Posit Posit
  2. Click en el botón “Download for Desktop”
  3. Sigue las instrucciones

Si ya tienen estos dos cosas en su computador por favor actualicen.

RevBayes

RevBayes es la herramienta más moderna para filogenética estadística.

  1. Crea una nueva carpeta en tu computadora donde sepas exactamente el path (por ejemplo en C:\Documentos)
  2. Si no sabes qué es el path te recomiendo que veas este video
  3. Ve al sitio de RevBayes RevBayes
  4. Bajen de acuerdo a su sistema en el folder que seleccionaron (Documentos) e instalen.
  5. Deben tener un folder que se llame \revbayes con la version y adentro otro folder llamado \bin

Tracer

Tracer es una herramienta para visualización de resultados del MCMC en aplicaciones filogenéticas

  1. Ve al sitio de Tracer
  2. Baja el archivo zip o tgz para Windows (dependiendo de la descompresión que tengas) o dmg para Mac.

Editor de texto

Asegúrate de que tienes un editor de texto para software (Notepad para Windows funciona). A mí en lo particular me gusta Sublime y sirve para Windows y Mac.

Identifica símbolos en tu teclado

Vamos a utilizar varios símbolos para hacer código, por favor escribe en un papel al lado de tu computadora cómo obtenerlos de tu teclado. A veces algunos alumnos tienen que copiarlos del internet y tenerlos en a la mano en un documento de texto.

Símbolos necesarios: \ / {} [] ~ : - < >